溯本寻源，古代大同安历史应该从有”同安”之名迄今也有1730多年。西晋太康三年(282年)析晋安县置同安县，然而从五代至民国初，同安县所辖区域包括金门与厦门，基本上沒有变动。其地图犹如一只梭子蟹，故有述同安像一只蟙，因城形状似银锭，故称为银城。

    金门古称浯洲、素有海上仙洲，桃沅胜境之美名，古书亦记载: [ 固若金湯，雄镇海门 ] ，其形似金锭，而又扼闽南门户。根据历史，金门自古属福建泉州府同安县管辖，至民国三年(1914年)金门始设置为县。风狮爷是金门岛上独特文化图腾。因金门四面环海，经常受风沙肆虐，故托付神明之威猛，来阻吓八方邪魔，从此以后风狮爷即成金门民众之守护神。

     厦门别称鹭岛、鹭洲。相传古代常有成群白鹭栖于此；又因曾经出现过一茎数穗的水稻而被称为嘉禾屿。本属同安管辖，至1913年11月自同安县析出嘉禾里、金门、大小嶝置思明县，后来改名厦门。

        马来西亚同安金门厦门联合总会是在1998年第三届世界同安联谊大会在我国马六甲州隆重举行时，所萌生筹备工作，当时马六甲同安金门厦门会馆会长拿督杨建谒局绅(同安人)，槟城州同安金门厦门公会会长拿杨集东局绅(同安人)，柔佛州金同厦会馆会长拿督陈成龙(金门人)，雪隆同安会馆会长拿督林顺平(同安人)，秘书呂清才(同安人)，雪兰莪金门会馆会长王豪杰(金门人)，雪兰莪厦门公会会长陈友信(厦门人)及砂拉越金门会馆会长甲必丹吳民权(金门人)等人皆认为三籍贯同乡应加強团结及广召更多州属成立同乡会的凝聚力，就像番薯情那样越牽越深，情牽血浓，情深谊挚。

     至2004年11月17日假槟城召集各友会商讨筹备工作，推选拿督陈成龙为筹备委员会主席，呂清才博士为秘书，方正式定名为马来西亚同安金门厦门联合总会，宗旨联合三籍贯同乡会，从大同安精神为慨念，加强交流，增进团结，同心同德，共谋同乡福祉。会议中也达致协议，初期首三届以轮值方式选出总会长，接着才依据章程以民主投票选贤与能的领导者。

     于2007年8月8日才正式获得社团注册局批准，至2008年秘书将批准信及章程影印寄给全国同乡会，并订于是年7月12日假柔佛州峇株巴辖商讨成立事宜。当天多数出席领袖认为章程有些不妥，必须先修改章程后再谈选举新届理事会，因此就延至2009年3月28日才正式产生首届理事会。第一任总会长为拿督陈成龙博士(金门人)，第二任总会长丹斯里林顺平(同安人)，第三任总会长陈友信硕士(厦门人)，现任总会长郭明发(同安人) 也是柔佛州金同厦会馆会长。目前本联合总会计有11个同乡属会即是柔佛州金同厦会馆，马六甲同安金门厦门会馆，雪隆同安会馆，雪兰莪金门会馆，雪兰莪厦门公会，砂拉越金门会馆，槟城州同安金门厦门公会，吡叻州同安金门厦门公会，下吡叻同安金门厦门公会，五条港同安联谊社及浮罗吉胆泉顺发公会。

    随着时代的步伐与需求，第二届总会长丹斯里林顺平乡长与总会理事会于2011年5月15日假雪隆同安会馆正式成立总会青年团，在首任团长苏永秋乡贤及现任团长张迎煌乡贤配合全体理事群策群力下，筹划多项本团品牌活动，如；常年捐血运动、凝聚同乡青年的2天1夜培训营、举办“桑梓企业访”培训乡亲创业知识等等.除此之外!本总理事也积极推动文化传承，华教发展及关注政经领域，引领乡青贴近社会脉搏，树立溯本追源的观念，汇集智慧与乡亲之力量，奠立磐固的团务根基，俾能承先启后，创造辉煌。